Всем спасибо, заработало! Нашел на сайте AD аппноту, где этот вопрос упомянут. Проблема была в том, что каждое переключение каналов сопровождается как бы "переходным процессом" во встроенном в АЦП цифровом фильтре, производитель гарантирует восстановление правильных показаний через 3 цикла измерения. Готовность данных выставляется также после 3х циклов. А я это не учел. Спасибо.