Ну, я не видел того станка о котором Вы говорите, так что, могу только предполагать, что можно делать ножи под каждую плату или сделать регулярные отверстия и все платы делать чтобы попадали в эти отверстия.
https://embedders.org - блоги разработчиков встраиваемых систем.