Дык, авотху ;) В силовых импульных трансформаторах все обычно как раз наоборот. Тут гальваноразвязка рулит. Поэтому начала и концы обмоток расположены как попало. А приоритетом является расстояние между контактами на каркасе гальваноразвязанных цепей.
Поэтому как правило первичные обмотки - на одной стороне трансформатора, а вторичные - на другой. Все делается из расчета того, какое пробивное напряжение между обмотками.