Все правильно, именно из-за значения РАБОЧЕЙ частоты в 5МГц (не меандр как написано выше, импульсы короче!) и выбрана частота защелкивания 100Гц (100*(2^16-1)). Аварийная частоты может быть больше и мне нужно четко знать защелкнутое значение CNT это рабочая частота (проводим вычисления) или аварийная (переход на обработчик ошибок). Нельзя проводить вычисления основываясь на АВАРИЙНОЙ частоте - данные будут не достоверны!