Да, есть такая фича: А просматривал тем же IAR-ом, через JTAGICE3. Но все же очень странно, что это влияет только на вектора прерываний.
Недавно тоже наткнулся на это (правда на xmega192a3u и с atmelstudio6) - вся страница 0 не показывается в отладчике, а остальные обновляются нормально. В итоге сделал так - зашил hex и потом считал весь дамп программатором - всё оказывается шилось нормально.