Не знаю, но думаю что по очереди. Обычно снизу греют ниже температуры плавления припоя и уже припаяные компоненты не отваливаются. Ну а порядок как lexxx-lexxx сказал. Сначала сторона с мелочевкой типа резисторов конденсаторов, а уже потом мелкосхемы и прочие трансформаторы.