В IrDA не пачка, а именно импульсы. Конечно не плохо бы профильтровать в диапазоне baud_rate/2...10*baud_rate, но на худой конец можно просто откинуть 50Гц мерцание ламп RC-цепочкой. http://www.societyofrobots.com/images/electronics_irda_encode_decode.png Какой ещё MCU. Речь о практически бесплатном решении (светодиод для индикации всё равно уже есть).