Характеристика температурной зависимости частоты часового кварца имеет вид "колокола" и описывается примерной формулой E = K * (T-T0)*(T-T0) + B. Так что нужно измерять температуру и учитывать поправку. На эту тему есть много рекомендаций на сайте http://www.maximintegrated.com/images/appnotes/58/58Fig02.gif http://www.maximintegrated.com/design/techdocs/app-notes/index.mvp/id/21#c21 Maxim.