...>>в случае с GCC смогу пользоваться STlink-ом? Это всё разные сущности: отладчик - редактор - компилятор.
Можно программу в машинных кодах писать и отлаживать ST-Link-ом...
Попробуйте поискать по словам texane и OOCD - freeware поддержка STLink теперь есть. Или купите JLink и отлаживайте любой Cortex.