У ЕФМ-а широко распространена фишка что одну и ту же периферию можно маппить на разные порты. Эта настройка висит в конфиге самого периферийного модуля. Возможно, у твоего гена тоже такая опция есть. глянь оциллом что на ноге кварца - логика, хай импеданс или аналоговый уровень гены.