ARM, RISC-V контроллеры

Может, усреднять вне обработчика DMA? Сделайте усреднение отдельной задачей и используйте т.н. отложенную обработку прерывания, по типу семафоров и прерываний freeRTOS, как описано в статьях Курниц(а). Пусть настоясчий обработчик только вгоняет очередную порцию в буфер и выставляет семафор.