Возможно этот софт обращается к FTDI микрухе не в "COM", а в "D2XX" режиме. http://www.ftdichip.com/Support/Utilities/FT_Prog_v3.0.56.245.zip
http://www.ftdichip.com/Drivers/D2XX.htm
Если, как
написал Скрипач, требуется только родной переходник, то, скорее всего, он сделан на FT232
R - у неё есть внутренняя ЭСППЗУ, доступная через этот "D2XX" режим. В эту память Carelовцы могли загнать индивидуальные идентификаторы, распознаваемые программой. Поэтому, для клонирования нужно считать внутреннюю память программой
FTProg и прописать дамп в свой FT232R переходник.