Что значит "плагин"? Эклипс сам по себе подсвечивает #if#endif, если знает где посмотреть на выражение. А если не знает, то не подсвечивает. Надо ему включить индексацию нужных файлов, в этом может помочь галка "индексировать все не используемые файлы" в настройках проекта. В особо запущенных случаях можно ему с С++ -> Symbols вписать нужные переменные со значениями.
https://embedders.org - блоги разработчиков встраиваемых систем.