С компа и обратно - не через USB-ли? Попробуйте прогнать эти 512к не через флэшь, а просто через МК и сравнить. У меня были сбои на FT232+Linux на 500кБод, пролечил тупым сниженим количества байт в пакете от МК.
1. Изо всех сил стараюсь не кормить троллей.
2. Продаю импортные ЭК - https://shop.fulcrum.ru/buy