Есть флешки, поддерживающие эмуляцию cd привода, а некоторые - нет. http://flashboot.ru/files/ Искать всё по ссылке, там и программки для разбивки флешки. Я свою 8 ГБ Кингстон разбил на два диска - собственно образ диска и остаток - обычный RW раздел 3 с чем-то гига.
Более-менее прогрессивные материнские платы поддерживают загрузку системы с такого USB DVD диска.