Х-Меги вполне хороши, но в E5 добавили сразу много разных фич и потому по части нововведений кое-где получилось сыровато. А ведь планировалось, что семейство Xmega-E будет обширным, а не ограничится E5. Вот и здесь возникла сырость по части переключения выхода PWM таймера - возник конфликт с SPI. Тогда как у более многоногих таких проблем нет, т.к. не приходится пины экономить, тесно совмещая их функции.