Поставил свежий IAR и драйвера от Segger. SAM-ICE (v9) обновился. J-link (v8) не захотел. Манипуляции с UART не помогли.
Пока удается работать включая питания на плату и нажимая кнопку прошить в IAR.
Со второго, третьего раза цепляется, потом можно отлаживать в штатном режиме.