В MPLAB Можно после компиляции открыть Program Memory, внести ручками любые изменения (на асме или в кодах) и запрограммировать/сохранить. Если сделать после этого компиляцию, то все изменения потеряются. Что можно и нельзя в MPLABX сказать не могу - не пользуюсь.