А некоторый софт хоть и через костыли, но запускается и работает как родной. Например, на днях обнаружил: email-клиент Thunderbird (portable) работает одинаково как под Win, так и под Ubuntu. Нативный под Linux не стал ставить, т.к. надо базу в одном месте держать.
P.S. пока приходится нырять из Win в Linux и обратно.