Мой моторный стенд с питанием от переделанного китайского сварочного аппарата на деревянном столе вел себя вполне хорошо, никаких проблем с ЮСБ. Но как только заказчик перенес его на железный верстак, началось. При токах более 120А ЮСБ отрубалось на некоторых ноутбуках, иногда вместе с проводной мышкой. Помогло соединение верстака с общим проводом стенда проводком.
З.Ы. ИМХО, вылавлимать десятые доли пФ в девайсе плохо, а вдруг юзер руку поднесет? Надо искать другие пути, какие точно - не знаю...