Ну я бы посоветовал сделать 2 канала классических диффренциальных усилителей, подключить их напрямую к измеряемым источникам, а опору(офсет) формировать отдельным оу, чтобы минимизировать взаимное влияние. Минус(землю) питания оу, можно почти любой цепью соединить с заземлением. Еще, лм358 для точных измерений плохой выбор.