Смотря сколько вольт. Через эту ёмкость шина питания МК соединяется с нагрузкой фактически. Ток может проходить так же через защитные диоды связанные с выводом МК. Что может, например, давать кратковременный подскок напряжения на шине питания (если конденсатор далеко от выводов МК стоит) и срабатывание brownout detector'а. Я тут кое чего не понимаю, с одной стороны пишут бывает возбуждение/звон на индуктивности дорожки нога-мк -- транзистор, с другой стороны сопротивление выхода МК далеко не околонулевое и так.