R9 выпаял. R10 не вижу смысла выпаивать. U21 вообще непонятно зачем выпаивать. Кроме этого схема CustomBoard не соответствует плате. R129 на плате есть, а в схеме нет. Проверил уже на трёх платах.
На двух своих и на КастомБоарде.
На одной моей плате и на КастомБоарде на SCK всегда 0. При подтяжке резистором 1кОм к +3.3В напряжение на SCK поднимается до +3.3В.
На второй моей плате на SCK всегда 2.7В. Хотя питание +3.3В. При подтяжке через 1кОм к земле, напряжение на SCK проседает до +1.4В.