Ничего такого "синхроннный противофазный ШИМ с паузой" не требуется :) Обычный набортный контроллер. Мерим температуру, напряжение. Сигналим при аварии. Правда еще одно требование появилось - смотреть форму сигнала на выходе. Без особой точности. Пока решенно остановиться на ATmega48 (TQFP 32).