нафик кастомные команды. единственная полезная для дела заточка софткоров - команды для облегчения/ускорения I/O из программы в железо и обратно. вместо остальных кастомных команд эффективнее сделать кастомные аппаратные блоки для обработки потока за пределами софткора.
например, вместо придумывания команды для подсчёта crc32, проще сделать блочок, который сам считает crc для пролетающих мимо него данных.