Только счетчиком частоту не измерить. Как? Нужен или счётчик + таймер (запускаемый и останавливаемый по фронту от счётчика) + свой термокомпенсированный генератор. Либо перемножитель + VCO (подстраивается до пропадания биений) + генератор опять же. Считывать счётчик через GET и проверять по генератору компьютера -- безумие.