Kceния (16.03.2020 19:22, просмотров: 405) ответил Evgeny_CD на А сколь сложен реальный секвенатор, насколько он большой, и сколько работает над одним образцом?Время работы с образцом прямо пропорционально длине секвенируемого участка ДНК (обычно гена). Однако сама я на нем никогда не работала, а получала с него bsq-файлы
http://77.72.19.19/temp/test.bsq
Эти файлы текстовые, сообщают интенсивность "линий" всех 4-нуклеотидов (A, C, G, T) на каждом шаге. Сам прибор пишет слева ту букву, чья интенсивность больше.
G A:0.00 C:0.20 G:0.76 T:0.04
Однако в реальности отклик может быть разным, например все G могут оказаться раза в 4 более интенсивными, чем C.
Впрочем, и сам недостаток этого прибора состоял именно с том, что пики точно не делил, и потому они частично друг на друга наползали.
Сейчас таких громоздких приборов наверняка нет. Да и методы секвенирования быстро совершенствуются, порой сменяясь совсем другими.
Недавно на Электрониксе обсуждался совсем революционный метод, который меня поразил в самое сердце: :)
https:/…x.php?app=forums&module=forums&controller=topic&id=154558
но потом я почитала про него и поняла, что он очень плохо работает.
-
- А по времени сколько секвенировать ДНК человека? - Evgeny_CD(16.03.2020 23:56)