WSL2 достаточно адекватная весчъ. кто такой MSYS я не знаю, но
разные типа yocto консольные линуксоидные утилы шустро работают в
"окошке". файлы линукса действительно живут в "виртуальном" диске,
но доступ из линукса к файлам виндовс как минимум через "шару"
(примонтировано). с точки зрения "пользователя" не существует
виндовз и линукс команд - все они "прозрачно" запускаются. Основная
засада - это сетевые возможности - я не смог из линукса отпинговать
компы из локальной сетки. ИМХО сиё по идее поправят когданибудь. VMVare должна работать (самая свежая версия - они обещали), VirtualBox 6.1.14 ни каким боком не работает, однако 6.1.15 вроде худо бедно работает. с другой стороны почему не воспользоваться уже имеющимся Hyper-V для того же линукса (с гуем) ? wsl2 ктомужемгновенно вызывается - её не требуется "запускать" как "виртуаку".
https://docs.microsoft.com/ru-ru/windows/wsl/