Средства и методы разработки

За изобретение нестандартных протоколов, видов модуляции и т.п. -- сжигать нужно. Практически предлагаемое является то ли ШИМ, то ли ЧИМ и активно используется в J1850, например, рекомендую к ознакомлению. И вы таки уж определитесь, либо постоянная составляющая не имеет значения, либо "нет низкочастотных составляющих в спектре". Нельзя усидеть на двух стульях одновременно. И самое главное, ряд ваших преимуществ и указанных ниже недостатков решаются уровнем выше, на этапе кодирования битового потока, а не модуляции физического сигнала -- не надо всё в одну кучу. В том числе и длинные последовательности нулей исключаются, вводится какой-то механизм синхронизации (для побайтового разделения) и т.п. И вполне возможно, что на деле метод NRZ вполне хорош и вам нужен какой-нибудь LINBUS... потому, что всё это (де)кодирование вручную побитово требует много CPU. А уж поверх UART' можно нагородить какое-то дополнительное кодирование с нужными свойствами. И обойтись без CPLD.