Средства и методы разработки

Там не жалкое подобие, там просто крайняя форма уродства. Структурированность а-ля windows-реестр на самом деле не нужна. Просто потому, что у разных типов файлов она своя (исходники на "C" структурированы языком "C", а у исходников на Lua, например, структура другая и нет смысла искать общий знаменатель кроме текстового файла). Не может быть единого на всех решения. Так уж исторически сложилось. Более того, файловая система уже предоставляет тебе структурированность. Где элементом структуры является файл. Ничто не мешает разные значения записывать в разные файлы, а мышкой таскать не файлы, а целиком каталоги. Современные файловые системы это вполне терпят, там есть специальные решения для работы с миллионом коротких файлов. Почему так не делают -- ноги растут у любимой Windows-95 с FAT'ом -- на ней это не может работать нормально...