Микроконтроллеры AVR

Может вы мне не поверите, но что называется "на зеркало пеняете". Или нет? 

Касательно XMEG, например, читаем, что есть регистры, защищаемые от модификации

Зато про каждый регистр, который защищён от записи чего попало, описано что можно в него писать в любой момент, а что - только через CCP. На саом деле там отдельные биты могут защищатся, но не весь регистр.

чтение даташита и

В смысле мануала?

Могли бы уж, кстати, типичные сценарии использования привести в вилде примеров. Ну скажем, запуск PLL, Запуск RTC, работа с конвейерами АЦП, конфигурирование таймеров, и т.п. а то в даташите - сухое описание регистров (да и то неоднозначное :

Есть и примеры (в разделе апнот. уже лет 5 как выложены) и просто библиотека (ASF), если лень с регистрами разбираться. avr1314:_using_the_XMEGA_rtc avr1300:_Using_the_XMEGA_ADC

В итоге, стартапе, фиг его знает, снимать лок с них

Хотите работать с регистрами, четайте их описание, там всё есть.

Студия 4,19 кривая, ё-моё, некоторые операции с регистрами вообще не отображает

Например? Но ведь она всего лишь симулятор. Лучше верить реально работающей схеме.

поди пойми, что они подразумевают, например под странным термином totem-pole

Z-state они подразумевают. Что же ещё?