В смысле? Ну, я бы взял ППФ или чего оптимального, чтобы
отфильтровать помеху меньшей частоты. Антиалиасинговый фильтр при
высокой частоте выборок будет простым. Дальше можно какое-нить
пороговое устройство для интеграццыи или ещо какой обработки 1мс
импульса. Поимели набор выборок выше порога, пожалте на дальнейшую
обработку.