В обвинительном заключении от 05.04.1937 г. Кашкин обвинялся в преступлениях, предусмотренных ст.ст. 19, 58-8,58-11 УК РСФСР (подготовка террористического акта, контрреволюционная оппозиционная деятельность). Дело было рассмотрено 06.04.1937г. на закрытом заседании Военной коллегии Верховного суда СССР без участия обвинения и защиты, без вызова свидетелей. Заседание открылось в 10 час. 45 мин. И закрылось в 11 час. вынесением приговора – расстрел с конфискацией имущества. Приговор был окончательным, обжалованию не подлежал и в тот же день был приведен в исполнение в г. Новосибирске.
По одному делу с Кашкиным прошли как участники троцкистской организации: Безденежных Н.М. – заместитель директора по административно-хозяйственной работе; Николаев Г.Р. – научный сотрудник кафедры «Двигатели внутреннего сгорания»; ассистент Солоницин Т.Я., аспиранты: Гадибиров А.Н., Горсунов П.И., Машкин Л.Г., Пышкин В.А.; студенты: Новиков И.С., Москаленко А.И., Шахтаров Г.Ф. Были обвинены в принадлежности к троцкистской организации и контрреволюционной деятельности и.о. заведующего кафедрой социально-экономических наук Копьев И.И., преподаватели этой кафедры Грунес Ф.Б., Лаптева О.И., Мясковская М.И. Многие из них также были приговорены к расстрелу. В 1958 г. следственное дело на К. было подвергнуто дополнительному рассмотрению Военным прокурором СибВО по Томской области и 03.07.1937 г. Военная коллегия Верховного суда СССР приговор в отношении Кашкина от 06.04.1937 г. отменила и дело было прекращено за отсутствием состава преступления. При проверке все показания К. и других лиц о проводимой контрреволюционной деятельности не нашли подтверждения, и все они были реабилитированы.