Думаю что способы можно будет поискать если часть прошивки будет известна, например, код операционной системы. В общем случае с AVR такое маловероятно, вся надежда на Ардуинщиков, использующих стандартный загрузчик, компилятор и библиотеки :) https://habrahabr.ru/post/265235/ Как примерно это может быть сделано, см. по ссылке.