Да практически любой сканер отпечатков позволяет через свой API получить картинку отпечатка. https://www.nist.gov/services-resources/software/nist-biometric-image-software-nbis
А потом картинку загоняете в NIST Biometric Image Software, и извлекаете ключевые точки отпечатка (minutiae), сравниваете (1:1), ищете (1:N) и т.д.
Если вдруг скорость или качество NIST не устроит, то есть коммерческие библиотеки, например VeriFinger от
http://www.neurotechnology.com/ - очень хороший вариант.